In einer Studie des Institut für Immunologie und Genetik Kaiserslautern wurden innerhalb von nur zehn Tagen insgesamt sechs komplette Streptokokkengenome - durchschnittliche Größe 2,5 MB - auf dem Genome Sequencer FLX Instrument mit den neuen Titanium-Reagenzien sequenziert. Es wurden durchschnittlich 84 Large Contigs je Bakteriengenom erhalten, in einem Fall sogar 36 Large Contigs mit einer mittleren Länge von 51 kB. Die Leseweiten lagen bei 470 +/- 70 bp (Maximum: 600 bp). Gegenüber früheren Ergebnissen der Arbeitsgruppe mit den Genome Sequencer FLX Standard Reagenzien zeigte sich mit den Titanium Reagenzien eine nochmalige deutliche Verbesserung der Performance in Bezug auf die Assemblierungsergebnisse, insbesondere bezüglich der Zahl und Länge der Contigs.
Die Studie ist Teil eines BMBF-Projektes zur vergleichenden Sequenzierung von Genomen verschiedener Meningitisisolate von Streptococcus pneumoniae. Die Ergebnisse des Projekts, einer Zusammenarbeit des Nano-Bio Centers der Uni Kaiserslautern mit dem Institut für Immunologie und Genetik Kaiserslautern, sollen helfen, unterschiedliche pathogenetische Aktivitäten der Bakterien besser erklären zu können.
Seit der Gründung 1997 konzentriert sich das Institut für Immunologie und Genetik Kaiserslautern auf hochspezialisierte Bereiche der immunologischen, molekularbiologischen und humangenetischen Diagnostik. Das Institut ist ein stetig wachsendes, modernes und eigenständig am Markt agierendes Unternehmen. Zu den Auftraggebern gehören Universitäten, spezialisierte Behandlungszentren und Schwerpunktpraxen, Kliniken, Forschungsinstitute, Unternehmen der forschenden Pharmaindustrie, Stammzellspender-Organisationen, sowie im Rahmen von Vaterschaftsgutachten Gerichte und Jugendämter aus Rheinland-Pfalz.
454 Life Sciences, ein Center of Excellence von Roche Applied Science, entwickelt und vermarktet das innovative 454-Sequenzierungssystem für die ultraschnelle Hochdurchsatz-DNA-Sequenzierung. Spezifische Anwendungsfelder der Technik sind zum Beispiel die De-novo-Sequenzierung und Resequenzierung von Genomen, Metagenomik, RNA-Analyse und die gezielte Sequenzierung bestimmter DNA-Bereiche. Das 454-Sequenziersystem zeichnet sich durch eine einfache Probenvorbereitung ohne einseitige Tendenzen und lange, präzise Leseweiten, auch bei Paired-Read-Sequenzierung, aus. Mit Hilfe der 454-Sequenziertechnologie sind viele in Peer-Review-Zeitschriften veröffentlichte Studien durchgeführt worden, in so unterschiedlichen Bereichen wie Krebsforschung, Infektiologie, Wirkstoffsuche, Meeresbiologie, Anthropologie, Paläontologie und vielen anderen. Weitere Informationen finden Sie auf http://www.genome-sequencing.com.
Die Studie ist Teil eines BMBF-Projektes zur vergleichenden Sequenzierung von Genomen verschiedener Meningitisisolate von Streptococcus pneumoniae. Die Ergebnisse des Projekts, einer Zusammenarbeit des Nano-Bio Centers der Uni Kaiserslautern mit dem Institut für Immunologie und Genetik Kaiserslautern, sollen helfen, unterschiedliche pathogenetische Aktivitäten der Bakterien besser erklären zu können.
Seit der Gründung 1997 konzentriert sich das Institut für Immunologie und Genetik Kaiserslautern auf hochspezialisierte Bereiche der immunologischen, molekularbiologischen und humangenetischen Diagnostik. Das Institut ist ein stetig wachsendes, modernes und eigenständig am Markt agierendes Unternehmen. Zu den Auftraggebern gehören Universitäten, spezialisierte Behandlungszentren und Schwerpunktpraxen, Kliniken, Forschungsinstitute, Unternehmen der forschenden Pharmaindustrie, Stammzellspender-Organisationen, sowie im Rahmen von Vaterschaftsgutachten Gerichte und Jugendämter aus Rheinland-Pfalz.
454 Life Sciences, ein Center of Excellence von Roche Applied Science, entwickelt und vermarktet das innovative 454-Sequenzierungssystem für die ultraschnelle Hochdurchsatz-DNA-Sequenzierung. Spezifische Anwendungsfelder der Technik sind zum Beispiel die De-novo-Sequenzierung und Resequenzierung von Genomen, Metagenomik, RNA-Analyse und die gezielte Sequenzierung bestimmter DNA-Bereiche. Das 454-Sequenziersystem zeichnet sich durch eine einfache Probenvorbereitung ohne einseitige Tendenzen und lange, präzise Leseweiten, auch bei Paired-Read-Sequenzierung, aus. Mit Hilfe der 454-Sequenziertechnologie sind viele in Peer-Review-Zeitschriften veröffentlichte Studien durchgeführt worden, in so unterschiedlichen Bereichen wie Krebsforschung, Infektiologie, Wirkstoffsuche, Meeresbiologie, Anthropologie, Paläontologie und vielen anderen. Weitere Informationen finden Sie auf http://www.genome-sequencing.com.
