Mit sinkenden Kosten und steigendem Durchsatz von Sequenzierungen benötigen Forscher ein leistungsfähiges und wirtschaftliches Probenvorbereitungssystem für die gezielte Sequenzierung. Roche NimbleGen (SIX: RO, ROG; OTCQX: RHHBY) kündigt jetzt die Einführung eines Multiplex-Protokolls für die Arbeitsschritte vor dem Capture-Schritt der Sequenzanreicherung an, mit dem die Probenvorbereitung für die gezielte Sequenzierung besser auf den immer weiter steigenden Durchsatz der Next-Generation-Sequenzierung abgestimmt werden kann. Mit diesem neuen Multiplex-Pre-Capture-Protokoll können mehrere DNA-Proben in einer einzigen SeqCap EZ Library-Reaktion für Exomanreicherungen oder andere Anreicherungsexperimente mit "Barcode" versehen und angereichert werden.
"Wir freuen uns sehr, Forschern ein leistungsfähiges und wirtschaftliches Multiplex-Pre-Capture-Protokoll zur Verfügung stellen zu können, mit dem sie den Umfang und damit die statistische Aussagekraft ihrer Studien zu erhöhen", sagte Frank Pitzer, Geschäftsführer von Roche NimbleGen.
Roche NimbleGen wird außerdem bald ein neues, umfassenderes Exom-Anreicherungsprodukt auf den Markt bringen. Dieses neue Produkt verwendet die gleiche Technologie mit hochdichten Sonden, die für die hohe Anreicherungseffizienz in allen bestehenden Produkten der SeqCap EZ-Reihe sorgt. Das neue Exom-Produkt wird jedoch 64 Mb an codierenden Exons und miRNAs abdecken und damit ein effizientes Sequenzanreicherungsprodukt mit der höchsten Abdeckung an codierenden Regionen darstellen.
"Mit NimbleGen SeqCap EZ Exome Library v3.0, der neuesten Erweiterung unserer Produktpalette für die Sequenzanreicherung, werden Forscher die gleiche branchenweit bekannte Leistung und Konstanz erhalten, die weltweit in vielen aktuellen Veröffentlichungen nachgewiesen wurde. In einer kürzlich in Nature Biotechnology veröffentlichten Studie[1] wurden mit NimbleGen SeqCap EZ bei 80 Millionen Reads ca. 97 % der interessierenden Basen mehr als 10-fach abgedeckt, während diese Abdeckung mit Technologien der Wettbewerber nur für ca. 90 % der interessierenden Basen erreicht wurde. Mit der SeqCap EZ Exome Library v3.0 wird außerdem die umfassendste Auswahl an Exons der Datenbanken RefSeq, CCDS, Vega und Ensembl im Markt abgedeckt", bemerkte Pitzer. Roche NimbleGen wird auch weiterhin das leistungsfähige Produkt SeqCap EZ Exome v2.0 als effizientes Hilfsmittel für Forscher, welche besonders kostengünstige Sequenzdaten für RefSeq-Exons generieren wollen, anbieten.
Weitere Informationen sowohl zum Multiplex-Pre-Capture-Protokoll als auch zu NimbleGen SeqCap EZ Exome v3.0 will Roche auf dem Jahrestreffen der American Society of Human Genetics (ASHG) nächste Woche in Montreal (Kanada) bekanntgeben. Sie können Roche auf dem ASHG-Kongress an Booth 502 besuchen.
Weitere Informationen über Roche NimbleGen finden Sie im Internet unter www.nimblegen.com.
[1] Clark et al., Performance comparison of exome DNA sequencing technologies (2011) Nature Biotechnology Onlineveröffentlichung 25. September 2011 doi:10.1038/nbt.1975
"Wir freuen uns sehr, Forschern ein leistungsfähiges und wirtschaftliches Multiplex-Pre-Capture-Protokoll zur Verfügung stellen zu können, mit dem sie den Umfang und damit die statistische Aussagekraft ihrer Studien zu erhöhen", sagte Frank Pitzer, Geschäftsführer von Roche NimbleGen.
Roche NimbleGen wird außerdem bald ein neues, umfassenderes Exom-Anreicherungsprodukt auf den Markt bringen. Dieses neue Produkt verwendet die gleiche Technologie mit hochdichten Sonden, die für die hohe Anreicherungseffizienz in allen bestehenden Produkten der SeqCap EZ-Reihe sorgt. Das neue Exom-Produkt wird jedoch 64 Mb an codierenden Exons und miRNAs abdecken und damit ein effizientes Sequenzanreicherungsprodukt mit der höchsten Abdeckung an codierenden Regionen darstellen.
"Mit NimbleGen SeqCap EZ Exome Library v3.0, der neuesten Erweiterung unserer Produktpalette für die Sequenzanreicherung, werden Forscher die gleiche branchenweit bekannte Leistung und Konstanz erhalten, die weltweit in vielen aktuellen Veröffentlichungen nachgewiesen wurde. In einer kürzlich in Nature Biotechnology veröffentlichten Studie[1] wurden mit NimbleGen SeqCap EZ bei 80 Millionen Reads ca. 97 % der interessierenden Basen mehr als 10-fach abgedeckt, während diese Abdeckung mit Technologien der Wettbewerber nur für ca. 90 % der interessierenden Basen erreicht wurde. Mit der SeqCap EZ Exome Library v3.0 wird außerdem die umfassendste Auswahl an Exons der Datenbanken RefSeq, CCDS, Vega und Ensembl im Markt abgedeckt", bemerkte Pitzer. Roche NimbleGen wird auch weiterhin das leistungsfähige Produkt SeqCap EZ Exome v2.0 als effizientes Hilfsmittel für Forscher, welche besonders kostengünstige Sequenzdaten für RefSeq-Exons generieren wollen, anbieten.
Weitere Informationen sowohl zum Multiplex-Pre-Capture-Protokoll als auch zu NimbleGen SeqCap EZ Exome v3.0 will Roche auf dem Jahrestreffen der American Society of Human Genetics (ASHG) nächste Woche in Montreal (Kanada) bekanntgeben. Sie können Roche auf dem ASHG-Kongress an Booth 502 besuchen.
Weitere Informationen über Roche NimbleGen finden Sie im Internet unter www.nimblegen.com.
[1] Clark et al., Performance comparison of exome DNA sequencing technologies (2011) Nature Biotechnology Onlineveröffentlichung 25. September 2011 doi:10.1038/nbt.1975
