Die Hauptanstrengungen galten einer schnellen Behebung von Betriebsunterbrechungen auf offener Strecke. Da die Kabinenbahn vollautomatisch zwischen den Stationen pendelt, ist kein Zugführer an Bord, der eine manuelle Steuerung im Störungsfall übernehmen könnte.
Die Lösung brachte die Nutzung eines Funkfernsteuerungssystems der Cattron-Theimeg Europe GmbH & Co. KG (CTE) aus Mönchengladbach, das seinen Einsatz vorwiegend im Bereich Schienenfahrzeuge und Rangieren findet. Das durch das Eisenbahnbundesamt zertifizierte und weltweit als erstes nach der Europäischen Norm für sicherheitsgerichtete Steuerungen für Lokomotiven EN 50239 entwickelte System TH-EC/LO von CTE gewährleistet die geforderten hohen Sicherheitsstandards für den Personenverkehr.
Bestandteile des Systems sind Empfänger mit Rückmeldesender in allen fünf Zügen der Bahn, die permanent aktiv sind. Eingebunden in die Sicherheitsschleife des Zuges, wird mittels des Fernsteuersenders im Störfall vom Automatikbetrieb auf Handbetrieb umgeschaltet. Der Bediener fährt dann mit einem Auto entlang der Strecke und steuert den Zug über Funk. Die vorhandene Störmeldung muss quittiert und die Fahrsperre der Funkfernsteuerung aufgehoben werden. Nach Vorwahl der Fahrtrichtung kann dann über den zentralen Fahr-/Bremsenschalter der Zug mit Schrittgeschwindigkeit gefahren werden.
Eine Räumung der Strecke wird in wenigen Minuten möglich, so dass Passagiere durch die schnelle Reaktion keine Flüge verpassen.
Sender und Empfänger sind aus Sicherheitsgründen als Doppel-Mikroprozessorsystem ausgeführt. Eine fehlersichere Überwachungselektronik vergleicht alle empfangenen Telegramme auf ihre Richtigkeit und führt die empfangenen Signale nur bei übereinstimmender Auswertung beider Rechner aus.
Durch diese und andere Maßnahmen wird eine Verfügbarkeit von 99 % erreicht - trotz aller Verbesserungen sind Betriebsunterbrechungen nicht vollkommen auszuschließen. Man kann also von einer positiven Erfolgsgeschichte des SkyTrains sprechen, u.a. durch den Einsatz des Funkfernsteuerungssystems TH-EC/LO von CTE.